erlug
[Top] [All Lists]

Re: [Erlug] data harvesting da pagina web

To: erlug <erlug@xxxxxxxxxxxxxx>
Subject: Re: [Erlug] data harvesting da pagina web
From: Federico Calboli <f.calboli@xxxxxxxxx>
Date: Tue, 12 Jun 2018 19:50:57 +0200
On 12 Jun 2018, at 18:38, Ivan Rossi <rouge2507@xxxxxxxxx> wrote:
> 
> io vedo due strade:
> 
> 1) installa bioperl o biopython che hanno le funzioni per interfacciarsi a 
> blast e parsare i risultati.
> 2) invece di usare un sito di dubbia qualità interfacciati con uno dei tool 
> di cui sopra al blast di NCBI o a quello dell EBI, che fanno lo stesso lavoro 
> ma da decenni.
> altrimenti più aggressivo ed educativo:
> 
> installa blast sul pc (deb: blast+) scaricati un database di riferimento e 
> compilalo con le opportune blast tools.
> interfacciati con bioperlo biopython e potrai costrire il report che vuoi.
> 
> Welcome to bioinformatics.

a dio piacendo sono problemi dello studente e non miei, per cui lascio che 
paciughi con il database che preferisce.

Ciao!

F


--
Federico Calboli
f.calboli@xxxxxxxxx

<Prev in Thread] Current Thread [Next in Thread>