On 30 Nov 2012, at 14:43, Davide Brini <db72@xxxxxxxxxxxx> wrote:
> Non so se ho capito, il tuo script viene chiamato una vola con n=1,
> un'altra con n=3 etc. e tu vuoi risalire da quel numero alla coppia di file
> che vuoi processare. Leggi tutti i file in un array:
dacche il mio indice lo da n=PBS_ARRAY_INDEX
immagino che:
>
> declare -a allfiles
> allfiles=( /groupvol/eph/Fede/GEUV1/ERR188*_1.fastq.gz )
index = $n #gia` fatto da qsub
>
>
> FILE1=${allfiles[index]}
> FILE2=${allfiles[index+1]}
e via! mo faccio un test che printi i nomi dei file coppia!
Grazie
F
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