On 3 Apr 2012, at 17:21, Davide Brini wrote:
> On Tue, 3 Apr 2012 17:10:19 +0100, Federico Calboli
> <f.calboli@xxxxxxxxxxxxxx> wrote:
>
>> io vogli sciappinarli a due a due, ovvero
>>
>> 1184_1_1.fastq.gz e 1184_1_2.fastq.gz vanno assieme
>>
>> seguiti da
>>
>> 1184_2_1.fastq.gz e 1184_2_2.fastq.gz
>>
>> eccetera. Ora, fare a mano so farlo anche io
>>
>> for file in 1184_1_*.fastq.gz
>> do
>> gunzip -c $file | cat > ${file/.fastq.gz/}.fastq
>> altriciappini
>> done
>>
>> ma farlo per todos in modo piu` svelto?
>
> Che vuol dire piu' svelto, se lo fai come sopra (redirezionando l'output)
> sei comunque limitato a usarne uno per volta.
voglio dire che il mio for loop fa 2 files, e per i prossimi 2 devo
*riscrivere* il loop. Se poi passo a 1184*.fastq.gz a un ultro numero (chesso,
1974*.fastq.gz), ho pure da scrivere di piu` testo.
F
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